Строительство метро в Красноярске ведется несколькими компаниями, среди которых генеральным подрядчиком является «Моспроект-3», а «Бамтоннельстрой-Красноярск» выступает в роли субподрядчика. «БТС» участвует в работах на четырех станциях, строя тоннели и сопутствующие сооружения. По последним данным, в компании трудится 1 347 сотрудников, а её выручка в прошлом году составила 10,1 миллиарда рублей с прибылью 218,9 миллиона рублей. Однако, несмотря на активы в 12,2 миллиарда рублей, собственный капитал компании отрицательный — -1,1 миллиарда рублей.
Ситуация осложнилась после появления письма от руководства «БТС» о приостановке работ из-за неплатежей. Позже водители другой субподрядной компании объявили забастовку. В ответ на это «Моспроект-3» подтвердил, что перечислил средства при наличии должной документации. Однако новостей о строительстве стало значительно меньше, и в официальном канале «Красноярское метро» отсутствуют публикации.
В конце 2025 года к «БТС» поступило множество исков на сумму почти 76 миллионов рублей, включая требования от различных поставщиков. Один из исков уже был проигран, что подтверждает, что проблемы с финансированием и выполнением обязательств у компании продолжаются. Аудиторы также отметили риски потери средств на проект. Срок завершения строительства перенесен с 2026 на 2028 год, и окончательная стоимость работ может возрасти до 130 миллиардов рублей.