Глава администрации Краснодара, Евгений Наумов, утвердил проект застройки зеленой зоны на набережной Юбилейного микрорайона, где будет построен храм. Это решение потребовало изменения генерального плана города, вызвав недовольство местных жителей, которые протестовали против застройки. Копия подписанного документа была обнародована активисткой Яной Антоновой, в которой указано размещение собора Пресвятой Богородицы в пределах зеленой зоны.
Ранее эта территория считалась рекреационной и предназначалась для парков. Когда власти сообщили о планах по строительству храма в 2021 году, местные жители активно выступили против. В августе 2024 года власти начали подготовку участка, а губернатор Вениамин Кондратьев заявил, что «храму быть».
Жители получили всего неделю для подачи замечаний к изменениям в генплан, что вызвало волну недовольства. Мэрия не согласовала митинги против застройки и активисты столкнулись с репрессиями. Новый генплан был принят большинством голосов депутатов городской думы, несмотря на протесты. В Волгограде также проходят акции против застройки прибрежной зоны, где жители пытаются остановить строительство жилого комплекса.